本文提供在Linux系统中进行NCBI BLAST+本地化的方法。实测环境为Linux64位系统，无ROOT权限。
本文面向初学者（最好还是懂得基本的linux使用），高手可直接忽视。不介绍Windows系统中的安装方法，一是因为思路一样，二是因为Linux中BLAST效率更高，系统更稳定，不会卡死。所以，请用Linux服务器，我想你也不忍心让自己心爱的本本跑几十个小时的程序吧。
请不要因为篇幅长，而觉得很困难，只是为了初学者能懂，叙述比较详（luo）细（suo）而已
——————-[ 做好心理准备，开始了]——————-
1. 安装配置BLAST+程序
在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/中下载最新的BLAST可执行程序（不要下载源代码`，源码编译非常慢），选择预编译版本，如ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz。如果服务器能联网，可直接用wget下载。或者，下载后用SFTP客户端传输到服务器上。
wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz
解压缩：
tar -zxvf ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz
（按理说解压缩后就可以通过绝对路径直接使用了，但为了今后的方便，还是继续配置吧）为了方便，将其移动到我安装本地程序的目录（参考《[Linux上设置良好的目录结构][1]》），并重命名（固定命名，不带版本号，避免因升级而修改配置文件），统一管理。
mv ncbi-blast-2.2.30+ ~/local/app/ # 移动
cd ~/local/app/ # 进入本地程序安装路径
mv ncbi-blast-2.2.30+ blast # 修改目录名
现在，已经将BLAST+安装到~/local/app/blast 中了（~知道吧，就是用户的家目录，可用环境变量$HOME代替）。
Avoid reinventing the wheels. [Recommended] FASTA Splitter – A perl script that divides a large FASTA file into a set of smaller equally sized files. Written by Kirill Kryukov. split_fasta from nash-bioinformatics-codelets How to split a Multiple fasta on Biostar
PLOS Computational Biology上发表了《Ten Simple Rules for Effective Computational Research》，可以看成是《Ten Simple Rules for Reproducible Computational Research》（可复现的计算科学研究十条简单规则，以及自己的一些经验）的姊妹篇，本文结合我自己的经验对其阐述。
Look Before You Leap
动手前先看看有没有现成的软件或库，避免重复发明轮子。
多Google，在代码仓储网站（Github，SourceForge，GoogleCode）上面多搜搜。
Develop a Prototype First
先建立原型。
先设想好软件要实现什么功能，提供什么接口，并将问题进行细化，这样开展起来才能思路清晰，也方便团队分工。另外，也可以先用伪代码，或者高级语言（Matlab、R、Python、Perl等）快速开发一个简化版的原型，随后再用“低级语言”进行优化。
Avoid reinventing the wheels. 2015-07 But I still have one: gff2fa.py GFF-Ex, a Genome Feature extraction package extracts Gene, Exon, Intron, Upstream Region of Gene (Promoters), Intergenic and CDS/cDNA sequences by just tweeting in the Genome Feature File (gff) along with the corresponding genome/chromosome sequence. Question: Extract cds fastas from a gff annotation + reference sequence from biostars.org [bioperl needed]
本文介绍如何在Perl中用正则表达式匹配汉字。
这是根据@灰灰 的建议的最新一次修改版本（2014-04-22）。
注：下列代码保存于UTF8编码的文本文件中，且命令行终端为UTF8编码。
本文介绍自己的重庆驾照科目三复盛电子路考考试经验，相信对大家非常有用。
考试项目
具体的可以google或者百度其它网站的说明。具体流程为：上车后首先进行模拟夜间灯光操作，起步；后续包括必考的通过路口、学校、公交车站，直线行驶、变道、靠边停车；可能要考的而是掉头。一般每个人行驶2-3公里。考试车型为90辆长安逸动和10量新桑塔纳（几乎抽不到，据说都是给关系户用的）。大多指令由电脑发出，变道和停车由安全员发出。考试总分100分，90分及格。
考试地点与线路
考试地点是重庆江北区复盛镇，具体请google。考场规划有三条线路，目前（2014年2月11日）只开通了1、2号线，今天考试的时候，似乎只考了一号线。
考试要领
这个笔记不系统，只是记录我个人认为的一些有意义的技巧，防止忘记，故记录于此。
last update 2014-10-06
代码风格
前面一篇中讲到利用多线程编程来充分利用多核来加速任务处理，Gearman则可以利用多台机器的多核。
Gearman 是一个任务分发系统，它提供了一个分发框架，能够分发某类任务到更适合处理这类任务的服务器上去处理。并且，它支持任务并行处理、负载均衡以及多语言调用。它的适用范围很广，从高可用性的网站到透明的数据库复制等。换句话说，它是一个强健的分布式通信处理系统。
据我有限的实践得到的一些经验：
如果电脑无法进入操作系统（Windows, Linux，Mac OS X均适用），可以用Linux Live CD拯救硬盘中珍贵的数据。
为什么要用Linux的Live CD呢，因为Linux系统能够兼容更多的磁盘格式，而windows系统盘里的Win PE只认fat, ntfs等；而Mac OS X的系统盘似乎没有Live功能。我常用的Linux Live CD是fedora，ubuntu。
虽然可以制作USB启动盘，但我试过多次，在很多笔记本、服务器上都有问题。最方便、稳定的还是刻CD/DVD，兼容性更强。如果有的笔记本没有DVD驱动，可以用移动光驱。